理化学研究所情報システム部

(課題番号順)

和光・基幹研究所

利用者氏名	所属	研究課題
宮崎 剛	戎崎計算宇宙物理研究室	オーダーN法第一原理計算プログラムの開発と応用計算
飯高 敏晃	戎崎計算宇宙物理研究室	第一原理計算による地球惑星科学
Thomas Mernik	戎崎計算宇宙物理研究室	Simulations for the JEM-EUSO Mission
Francesco Fenu	戎崎計算宇宙物理研究室	Study on the performances of the JEM-EUSO mission
真貝 寿明	戎崎計算宇宙物理研究室	高次元ワームホールの安定性解析
Kholmirzo Kholmurodov	戎崎計算宇宙物理研究室	MD Simulations on Material Science Models and Biomolecules
Jose Alberto Morales de los Rios Pappa.	戎崎計算宇宙物理研究室	Development and test of software to be used for JEM-EUSO simulation and event reconstruction.
Elias Iwotschkin	戎崎計算宇宙物理研究室	Neutrino Simulation for the JEM-EUSO Mission
山本 大輔	古崎物性理論研究室	変分クラスタ法による重い電子系s波超伝導と反強磁性秩序の解析
Giacomo Marmorini	古崎物性理論研究室	Condensed matter physics (theory)
森本 高裕	古崎物性理論研究室	Theory of optical responses in graphene quantum Hall system
堤 康雅	古崎物性理論研究室	超流動ヘリウム３におけるマヨラナ粒子の理論研究
上田 宏	古崎物性理論研究室	テンソルネットワーク状態による量子スピン系の解析
小野田 繁樹	古崎物性理論研究室	Electronic structure calculations for pyrochlore Ir/Rh oxides
Erik Loetstedt	緑川レーザー物理工学研究室	Atoms and molecules driven by relativistic laser fields
鹿嶋 行雄	平山量子光素子研究室	紫外線LEDの光取出し効率のシミュレーション解析
岡本 隆之	石橋極微デバイス工学研究室	2次元プラズモニック結晶の光学特性
藤澤 知績	田原分子分光研究室	超高速ラマン分光による生体内分子反応の研究
圓谷 貴夫	加藤分子物性研究室	第一原理計算による有機導体の電子構造に関する理論研究
草本 哲郎	加藤分子物性研究室	機能性ラジカル分子の電子状態の解明
光武 亜代理	杉田理論分子科学研究室	拡張アンサンブル法による小タンパク質のフォールディングシミュレーション
大滝 大樹	杉田理論分子科学研究室	分子論的アプローチに基づいた分子性結晶における誘電物性の理論研究
斉藤 竜男	内山元素化学研究室	ポリエーテル系天然物の新規収束的合成法の開発
青山 哲也	内山元素化学研究室	有機半導体の構造物性相関（Molecular packing and electronic property in organic semiconductor）
巳上 幸一郎	内山元素化学研究室	アラインの重合の理論的解析
平野 圭一	内山元素化学研究室	Mechanistic Studies on Fluorination and Fluoroalkylation Reactions
村中 厚哉	内山元素化学研究室	近赤外吸収π共役化合物の電子構造解析
平井 剛	袖岡有機合成化学研究室	有機化合物のコンホメーション、エネルギー解析
森田 昌樹	袖岡有機合成化学研究室	フィサリンの合成研究
五月女 宜裕	袖岡有機合成化学研究室	触媒的ラジカル反応の開発
山田 太郎	小林脂質生物学研究室	Dmol3 及びVASP による固体表面吸着分子構造の計算
GREIMEL Peter	小林脂質生物学研究室	Biomembranes – 10N-Nonyl Acridine Orange Inhibits Cardiolipin Polymorphism
佐藤 遼太朗	小林脂質生物学研究室	DMol3を使った金属表面における分子の吸着構造の計算
Qinfang Zhang	柚木計算物性物理研究室	Numerical study on new functionality of spin-heat cross effect
柚木 清司	柚木計算物性物理研究室	強相関電子系格子模型の電子状態の研究
白川 知功	柚木計算物性物理研究室	動的密度行列繰り込み群法を用いた強相関多体系の研究
関 和弘	柚木計算物性物理研究室	自己エネルギー汎関数理論に基づく強相関電子系の数値的研究
佐藤 年裕	柚木計算物性物理研究室	スピン軌道相互作用が強い強相関電子系における電子状態の数値的研究
西口 和孝	柚木計算物性物理研究室	Sr2IrO4の超伝導性に関する研究
Wei Fan	柚木計算物性物理研究室	Theoretical Modeling of Surface/Interface States in Topological Materials
Qing Xie	柚木計算物性物理研究室	Theoretical prediction of new graphene allotropes
田中 拓男	田中メタマテリアル研究室	プラズモニック・メタマテリアルの電磁気学的解析
竹嶋 伸之輔	分子ウイルス学特別研究ユニット	Ab initio prediction of structural undetermined protein
竹嶋 伸之輔	分子ウイルス学特別研究ユニット	NGSによるMHC領域のリシークエンス
Pulak Kumar Ghosh	理論科学連携研究推進グループ 階層縦断型物性物理学研究チーム	Theoretical Modeling of Photosynthesis
Robert Johansson	理論科学連携研究推進グループ 階層縦断型物性物理学研究チーム	Quantum mechanics in superconducting electrical circuits
加藤 雅樹	理研- マックスプランク連携研究センター システム糖鎖生物学研究グループ 糖鎖構造生物学研究チーム	Glycoinformatics
篠崎 健児	宇宙観測実験連携研究グループ EUSO チーム	Generation of cosmic ray air showers at a large statistics
Mario BERTAINA	宇宙観測実験連携研究グループ EUSO チーム	Simulation of Ultra High Energy Cosmic Rays for a space-based telescope
Lech Wiktor Piotrowski	宇宙観測実験連携研究グループ EUSO チーム	Sources identification for JEM-EUSO
Marco Casolino	宇宙観測実験連携研究グループ EUSO チーム	Study of ultra-high energy cosmic rays from space with the JEM-EUSO experiment
中村　健道	連携支援ユニット	計算化学手法を用いた気相有機イオン構造モデルの評価

創発物性科学研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
加藤 康之	強相関物理部門 量子物性理論研究チーム	立方異方性のある量子磁性体のモンテカルロシミュレーション
中野 正浩	超分子機能化学部門 創発分子機能研究グループ	新規有機半導体材料の開発
江野澤 英穂	超分子機能化学部門 ソフトマター構造創発研究チーム	ヤヌスジオン骨格を基盤とした新しいエネルギー変換材料
但馬 敬介	超分子機能化学部門 創発機能高分子研究チーム	有機半導体高分子の電子状態計算
太田 幸宏	量子情報エレクトロニクス部門 量子凝縮物性研究グループ	Direct numerical simulation of superconducting detectors
Veaceslav Misco	量子情報エレクトロニクス部門 量子凝縮物性研究グループ	Using Artificial Microswimmers for Particle Rectification
Georgios Giavaras	量子情報エレクトロニクス部門 量子凝縮物性研究グループ	Microwave-driven quantum dots
Henri Saarikoski	量子情報エレクトロニクス部門 スピン物性理論研究チーム	Spin Transport in Quantum Rings

光量子工学研究領域

利用者氏名	所属	研究課題
鈴木 喜一	エクストリームフォトニクス研究グループ 分子反応ダイナミクス研究チーム	水分子クラスター負イオンの光脱離積分断面積の計算
小城 吉寛	エクストリームフォトニクス研究グループ 分子反応ダイナミクス研究チーム	交差分子線画像観測法を用いた化学反応機構の研究
竹本 智子	エクストリームフォトニクス研究グループ 画像情報処理研究チーム	領域抽出法の性能評価に関する研究
深作 和明	エクストリームフォトニクス研究グループ 画像情報処理研究チーム	脳血管内治療検討予測手法確立の為の血流計算
Fumie Costen	エクストリームフォトニクス研究グループ 画像情報処理研究チーム	Numerical simulation of electromagnetic wave propagation in human body
保科 宏道	テラヘルツ光研究グループ テラヘルツイメージング研究チーム	高分子低周波振動スペクトルの量子化学計算
坪田 健一	光量子技術基盤開発グループ 先端光学素子開発チーム	細胞運動の生体力学シミュレーション

環境資源科学研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
佐藤 玄	先進機能元素化学研究チーム	Anthocyanidinの生合成経路の探索
滝田 良	先進機能元素化学研究チーム	アート錯体による反応機構解析
大塚 麻衣	先進機能元素化学研究チーム	金属触媒を用いるクロスカップリング反応の機構解明
村田 亮	先進機能元素化学研究チーム	亜鉛アート錯体を用いたカルボン酸の直接的ケトン化反応
吉田 健吾	先進機能元素化学研究チーム	機能性亜鉛アート錯体の創製と機能
下條 弘平	先進機能元素化学研究チーム	機能性銅アート錯体の創製と機能
王 超	先進機能元素化学研究チーム	亜鉛試薬を用いる新しいクロスカップリング反応機構の研究
水越 祥英	先進機能元素化学研究チーム	ラジカル重縮合の理論的解析
近山 英輔	統合メタボロミクス研究グループ 環境代謝分析研究チーム	NMRメタボロミクス用理論化学シフトデータベースの構築
河村 優美	ケミカルバイオロジー研究グループ 分子リガンド標的研究チーム	タンパク質修飾の網羅的解析
松井 南	バイオマス工学連携部門 合成ゲノミクス研究チーム	De novo assembly of rubber transcriptome

生命システム研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
安田 聡子	細胞動態計測コア 生体分子構造動態研究チーム	QBiC生体分子構造動態研究チームの遠隔地バックアップ
藤本 浩文	生命モデリングコア 計算分子設計研究グループ	分子動力学法を用いたプレＢ細胞レセプターnon-Ig領域の相互作用の解析
大塚 教雄	生命モデリングコア 計算分子設計研究グループ	創薬スクリーニングへの実用利用に向けたタンパク質/核酸－制御分子複合体間に働く相互作用に関する大規模電子状態計算手法
佐藤 雄士	生命モデリングコア 計算分子設計研究グループ	分子動力学によるタンパク質凝集性の分析
古石 貴裕	生命モデリングコア 計算分子設計研究グループ	機能性界面上における水滴の分子シミュレーション
小須田 慧司	生命モデリングコア 計算分子設計研究グループ	MDシミュレーションによるタンパク質凝集に関する温度・濃度依存性解析
小松 輝久	生命モデリングコア 計算分子設計研究グループ	計算機による結合自由エネルギー評価手法の研究

発生・再生科学総合研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
Juan Pascual Anaya	形態進化研究グループ	Transcriptome assembly and differential expression analysis
本多 久夫	形態形成シグナル研究グループ	Morphogenesis of multi-cellular organisms
Dimitri Perrin	センター長戦略プログラム システムバイオロジー研究プロジェクト	Role of Epigenetic Mechanisms in Circadian Clock Mechanisms
Craig Jolley	センター長戦略プログラム システムバイオロジー研究プロジェクト	Parameterization of a mammalian circadian clock model

脳科学総合研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
Thomas Launey	Launey研究ユニット	Simulation of molecular signaling during synaptic plasticity
大石 衡聴	言語発達研究チーム	日本語母音無声化の知覚に伴う脳活動について
宮澤 幸希	言語発達研究チーム	音素カテゴリ獲得過程の計算論的解析
小松 三佐子	適応知性研究チーム	MTRNNを用いたECoG信号の再構成
中谷 裕教	情動情報連携研究チーム	両眼視野闘争を用いた表情認知モデルの検討

統合生命医科学研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
森園 隆	医科学数理研究グループ	データの保管
宮 冬樹	医科学数理研究グループ	同一染色体内でのcis-およびtrans-eQTL解析
木村 周平	統合細胞システム研究チーム	生化学反応ネットワークモデル化のためのパラメータ推定

バイオリソースセンター

利用者氏名	所属	研究課題
宮 冬樹	医科学数理研究グループ	同一染色体内でのcis-およびtrans-eQTL解析
木村 周平	統合細胞システム研究チーム	生化学反応ネットワークモデル化のためのパラメータ推定
井上 潤一	微生物材料開発室	微生物遺伝子の大規模な分子系統学的解析
天野 晃	情報解析技術室	Clustering or alignment of DNA sequence data

ライフサイエンス技術基盤研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
Kam Zhang	構造・合成生物学部門 構造バイオインフォマティクス研究チーム	Protein Folding Prediction Using X-ray Diffraction Data as Constraints
本間 光貴	構造・合成生物学部門構造バイオインフォマティクス研究チーム	網羅的計算による高効率インシリコスクリーニングの実現
古谷 利夫	構造・合成生物学部門 生命分子制御研究グループ 制御分子設計研究チーム	レプリカ交換法によるアミロイドβ（Aβ）の立体構造予測
山崎 俊夫	構造・合成生物学部門 NMR 施設	NMRデータによるたんぱく質の構造多形解析
橋本 浩介	機能性ゲノム解析部門 LSA 要素技術研究グループ トランスクリプトーム研究チーム	ENCODEプロジェクト
Michiel de Hoon	機能性ゲノム解析部門 LSA 要素技術研究グループ ゲノム情報解析チーム	Whole-genome alignment of higher organisms
Anton Kratz	機能性ゲノム解析部門 LSA 要素技術研究グループ ゲノミクス微量技術開発ユニット	High-Throughput profiling of Purkinje neuron dendrites during memory formation and neuronal stress

計算科学研究機構

利用者氏名	所属	研究課題
原田 隆平	研究部門 プログラミング環境研究チーム	蛋白質機能解析のための自由エネルギー地形計算手法の開発
数納 広哉	研究部門 連続系場の理論研究チーム	量子計算による原子少数多体系の研究
中嶋 隆人	研究部門 量子系分子科学研究チーム	大規模分子理論の開発と応用
中塚 温	研究部門 量子系分子科学研究チーム	相対論的量子モンテカルロ法の開発
秋永 宜伸	研究部門 量子系分子科学研究チーム	Development of massive parallel ab initio quantum-chemical program
河東田 道夫	研究部門 量子系分子科学研究チーム	大規模系の超並列量子化学計算のための理論およびアルゴリズムの開発
松井 亨	研究部門 量子系分子科学研究チーム	人工核酸塩基による新規ナノマテリアルの理論設計
依田 隆夫	研究部門 粒子系生物物理研究チーム	蛋白質構造形成の分子シミュレーション
鈴木 惣一朗	研究部門 プログラム構成モデル研究チーム	種々なアプリケーションプログラムの性能解析
宋 鍾元	研究部門 平尾計算科学研究ユニット	The development of new long-range DFT functional
Rahul Kar	研究部門 平尾計算科学研究ユニット	Computation of frontier orbital energies for atoms and molecules using LC-DFT
川島 雪生	研究部門 平尾計算科学研究ユニット	計算コストがO(N)となる新規長距離補正密度汎関数法の開発
Florence Tama	研究部門 計算構造生物学研究ユニット	Developments of computational tools to interpret low-resolution structural data
庄司 文由	運用技術部門 システム運転技術チーム	次世代スパコン向け格子QCDコードの最適化
寺井 優晃	運用技術部門 ソフトウェア技術チーム	高並列アプリケーションプログラムの研究開発

仁科加速器研究センター

利用者氏名	所属	研究課題
鈴木 博	初田量子ハドロン物理学研究室	超対称性場の理論の数値シミュレーション
Pascal Naidon	初田量子ハドロン物理学研究室	Exploring the physics of nuclear matter and ultra-cold gases
山本 新	初田量子ハドロン物理学研究室	格子ゲージ理論に基づくハドロン物理学の非摂動的解析
佐野 崇	初田量子ハドロン物理学研究室	Complex Langevin dynamics in a random matrix model
日高 義将	初田量子ハドロン物理学研究室	有限温度有限密度量子色力学の数値シミュレーション
境 祐二	初田量子ハドロン物理学研究室	第一原理による有限密度 QCD の研究
佐々木 勝一	初田量子ハドロン物理学研究室	格子QCD計算に基づくハイペロンβ崩壊の研究
尾崎 翔	初田量子ハドロン物理学研究室	格子QCDを用いたグルーオン凝縮に関する研究
吉田 信介	初田量子ハドロン物理学研究室	格子QCDを用いた核子構造の研究
名和 要武	初田量子ハドロン物理学研究室	ホログラフィックQCDを用いたハドロン物理学の研究
Nguyen Dinh Dang	中務原子核理論研究室	Properties of finite systems including nuclei at high temperature and angular momentum (Properties of highly excited nuclei)
Nguyen Quang Hung	中務原子核理論研究室	Study of nuclear structure by using many-body theory
佐藤 弘一	中務原子核理論研究室	不安定原子核の微視的理論
吉田 賢市	中務原子核理論研究室	QRPA計算コードの並列化
渡辺 元太郎	中務原子核理論研究室	光格子における超流動Fermi気体のバンド構造
Lu Guo	中務原子核理論研究室	Structure and dynamics of nuclear large amplitude collective motion
中務 孝	中務原子核理論研究室	時間依存密度汎関数理論による核子多体系の量子ダイナミクスの研究
前澤 祐	橋本数理物理学研究室	格子QCDによる強相関クォーク・グルーオン・プラズマの解明
青木 和也	延與放射線研究室	AnsysによるGEM電場シミュレーション
中村 純	延與放射線研究室	有限密度QCDの大規模並列シミュレーション
Tara Prasad Das	岩崎先端中間子研究室	First Principles Study of Muon and Muonium in Heme Systems
飯沼 裕美	岩崎先端中間子研究室	J-PARCにおけるg-2/EDM実験準備のためのシミュレーション
Roger Pink	岩崎先端中間子研究室	Transition Metal Impurities in Semiconductors
Shukri Sulaiman	岩崎先端中間子研究室	Computational Studies of muon location
磯部 忠昭	櫻井ＲＩ物理研究室	RIBFにおけるSAMURAI-TPCを用いた非対称高密度核物質の研究
山田 真也	玉川高エネルギー宇宙物理研究室	ガス検出器内の電場計算
金子 健太	玉川高エネルギー宇宙物理研究室	X線偏光計の電場シミュレーション
奥野 広樹	加速器基盤研究部　加速器高度化チーム	超電導共振器の検討
Andreas Adelmann	加速器基盤研究部　加速器高度化チーム	Beam dynamics simulation in accelerators
大西 純一	加速器基盤研究部　加速器高度化チーム	RIBF加速器の電磁場及び構造計算
久保木 浩功	加速器基盤研究部　加速器高度化チーム	RIBFにおける荷電ストリッパーへの熱負荷の計算
福西 暢尚	加速器基盤研究部 運転技術チーム	重イオン加速器科学における多粒子シミュレーション
大西 哲哉	実験装置開発室 ＲＩ・電子散乱装置開発チーム	不安定核生成における熱負荷及び放射線損傷計算
石井 公太郎	応用研究開発室 生物照射チーム	雌雄異株植物ヒロハノマンテマの性染色体連鎖遺伝子の単離
望月 優子	望月雪氷宇宙科学研究ユニット	重力崩壊型超新星爆発とそれに伴う重元素合成の研究
秋吉 英治	望月雪氷宇宙科学研究ユニット	化学気候モデルを用いた天体活動の地球大気への影響に関する研究

HPCI計算生命科学推進プログラム

利用者氏名	所属	研究課題
池部 仁善	HPCI計算生命科学推進プログラム	H3 ヒストンテイルの構造探索

情報基盤センター

利用者氏名	所属	研究課題
須永 泰弘	情報基盤センター	細胞シミュレーション統合プラットフォームを用いた細胞内現象の理解
高橋 直也	情報基盤センター	並列計算技術の数値流体力学への応用
石川 顕一	情報基盤センター	重粒子線治療のためのモンテカルロ線量計算
米澤 康滋	情報基盤センター	量子古典ポテンシャル連成分子動力学
南里 豪志	情報基盤センター	大規模並列計算機の効率的な利用・運用に関する研究
塩崎 聖治	情報基盤センター	血小板凝集のマルチスケール解析
滝沢 寛之	情報基盤センター	ナノ粒子生成シミュレーションの高速化
古田 琢哉	情報基盤センター	大規模モンテカルロシミュレーションによる重粒子線線量分布の評価手法の研究
二階堂 愛	情報基盤センター	次世代シーケンサーのバイオインフォマティクス解析
泰地 真弘人	情報基盤センター	心筋梗塞・脳梗塞のマルチスケールシミュレーション
趙 武魁	情報基盤センター	4D Cell Information Communication Platform
杉山 和靖	情報基盤センター	生体力学シミュレーションソフトウェアの研究開発 Software Development for Biomechanical Simulations
検崎 博生	情報基盤センター	Coarse-grained biomolecular simulation by CafeMol
田村 沙織	情報基盤センター	ビオトープ環境解析
横山 尚弥	情報基盤センター	量子化学計算プログラムパッケージの並列性能の評価と最適化
杉山 和靖	情報基盤センター	剛体回転を伴う流体構造連成について On the fluid-structure interaction simulation with a rigid body rotation
中村 春木	情報基盤センター	GPUを用いた生体高分子の高速分子動力学計算

社会知創成事業

利用者氏名	所属	研究課題
横島 智	イノベーション推進センター 中村特別研究室	分子の特性を引き出すナノサイズ構造体が作る場の研究