English Annual Reports of FY2025 2025年度成果利用報告書 利用者氏名 所属 研究課題 久間 晋 開拓研究所 東原子分子物理研究室 量子波束イメージングによるナノ超流動ダイナミクスの解明 久間 晋 開拓研究所 東原子分子物理研究室 理研極低温イオン蓄積リングを用いた分子イオンの内部エネルギー移動の解明 岩崎 信太郎 開拓研究所 岩崎RNAシステム生化学研究室 タンパク質合成の網羅的解析 藤山 茂樹 開拓研究所 上野核分光研究室 第一原理計算による分子性導体の高圧下電子状態 Chee Fai Fong 開拓研究所 加藤ナノ量子フォトニクス研究室 Photonic structures for light-matter coupling 川口 喬吾 開拓研究所 川口生体非平衡物理学研究室 Exploring the inter-molecular interaction rules of disordered region of proteins 深井 洋佑 開拓研究所 川口生体非平衡物理学研究室 一分子観察によるクロマチン鎖の生物物理学的特徴づけ Rory Thomas Cerbus 開拓研究所 川口生体非平衡物理学研究室 Determining repeat elements de novo across the tree of life Chi Zhang 開拓研究所 Kim表面界面科学研究室 Exploring on-surface molecular synthesis under ultrahigh vacuum conditions 春山 潤 開拓研究所 小林固体化学研究室 第一原理分子動力学法を用いたヒドリドイオン伝導体の研究 Paul Pirlot Jankowiak 開拓研究所 坂井星・惑星形成研究室 Collisional excitation of H2CO deuterated isotopologues by H2 本橋 昌大 開拓研究所 杉田理論分子科学研究室 Elucidation of biomolecular mechanisms through molecular dynamics simulation 鈴木 志野 開拓研究所 鈴木地球・惑星生命科学研究室 Analysis of microbial diversity, adaptation, and evolution 岩村 宗高 開拓研究所 田原分子分光研究室 遷移金属錯体の超高速ダイナミクスの研究 Liyi Gu 開拓研究所 玉川高エネルギー宇宙物理研究室 Atomic database for X-ray astrophysics 水田 晃 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 Numerical Study of Relativistic jet launch and propagation 木戸 英治 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 Simulations of the propagation of ultra-high energy cosmic ray nuclei 伊藤 裕貴 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 第一原理計算に基づいたショックブレイクアウトの理論研究 小野 勝臣 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 3次元流体数値計算に基づく超新星爆発から超新星残骸までの物理化学進化の解明 Sudipta Hensh 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 Multimessenger astrophysics from binary neutron star mergers 武井 勇樹 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 Improved hydrodynamical simulations of gamma-ray burst central engines 樋口 諒 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 銀河磁場モデルに基づく最高エネルギー宇宙線起源天体の特定 平井 遼介 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 Hydrodynamical modelling of binary interaction-powered supernovae Maxim Vladimirovich Barkov 開拓研究所 長瀧天体ビッグバン研究室 Fast moving pulsars Pulak Kumar Ghosh 開拓研究所 Nori理論量子物理研究室 Collective properties of self-propelled particles: Diffusion and Non-equilibrium phenomenon 橋本 卓也 開拓研究所 橋本分子合成機能研究室 新規有機合成法と分子機能の開拓 中田 真秀 開拓研究所 柚木計算物性物理研究室 第一原理計算による大量の分子計算と機械学習モデルの構築 山崎 大介 開拓研究所 渡邉分子生理学研究室 Optimization of crRNA to activate Cas activity by machine learning シュパイデル 玲雄 数理創造研究センター 数理基礎部門 数理遺伝学理研ECL研究ユニット Uncovering human origins and millennia of genome evolution through whole-genome genealogies 横田 宏 数理創造研究センター 数理基礎部門 ”ねじれ”の自由度を持つ高分子の緩和モードの解明 岡田 崇 数理創造研究センター 数理基礎部門 集団構造と進化ダイナミクス 境 祐二 数理創造研究センター 数理基礎部門 Mathematical modeling of intracellular dynamics 土井 琢身 数理創造研究センター 数理基礎部門 QCD第一原理計算に基づくハドロン間力と有限密度QCD物質の研究 Yongjia Huang 数理創造研究センター 数理基礎部門 General relativistic simulation for binary neutron star merger 青木 匠門 数理創造研究センター 数理基礎部門 格子ゲージ理論を用いたブラックホール周りのDiracフェルミオンの解析 垂水 勇太 数理創造研究センター 数理展開部門 予測科学研究チーム 高次元状態空間モデルに対するデータ同化問題への機械学習の応用 飯高 敏晃 計算科学研究センター 離散事象シミュレーション研究チーム 結晶構造と物性の予測法 飯高 敏晃 計算科学研究センター 離散事象シミュレーション研究チーム Design of nonlinear optical crystals 飯高 敏晃 計算科学研究センター 離散事象シミュレーション研究チーム Materials under high pressure 神谷 宗明 計算科学研究センター 量子系分子科学研究チーム メモリ分割並列化された時間依存密度汎関数理論計算プログラムの開発 中嶋 隆人 計算科学研究センター 量子系分子科学研究チーム 量子化学計算ソフトウェアの開発と応用 Jong-Won Song 計算科学研究センター 量子系分子科学研究チーム Development of new long-range corrected density functional theory and its applications Brandon Cooper 計算科学研究センター 量子系分子科学研究チーム Exploring the use of Pair-Natural Orbitals for Time-Domain Coupled-Cluster Amrit Sarmah 計算科学研究センター 量子系分子科学研究チーム Decoding Hydrogen-Bonding Patterns for Electronic Conductance Modulation in Peptide-Based Molecular Junctions Himadri Pathak 計算科学研究センター 量子系分子科学研究チーム Advancing Quantum Chemistry with Heterogeneous High-Performance Computing 長尾 一馬 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Quantum simulation of quantum many-body systems 大塚 雄一 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Numerical study of strongly correlated electron systems 遠山 貴巳 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム 強相関電子系のスピン・電荷ダイナミクス 白川 知功 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Tensor network simulation for quantum many-body problems 幸城 秀彦 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Simulation of quantum many-body systems by tensor network method Xu Han 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Implementing the Gutzwiller wave function for SU(3) fermions Lukas Broers 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Development of efficient many-body quantum simulations and quantum algorithms 高橋 雅大 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Flux binding effect on spin-3/2 impurities of the Kitaev spin liquid Ravi Teja Ponnaganti 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Computational Study of Tensor Network Methods for the Honeycomb and Maple Leaf Lattices 高橋 佑瑚 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム 光照射下における量子開放系のダイナミクスに対する数値計算法の開発 Shaoxiong Li 計算科学研究センター 量子系物質科学研究チーム Quantum Droplets and Supersolidity in Molecular Bose-Einstein Condensates Cheng Tan 計算科学研究センター 粒子系生物物理研究チーム Development of multi-scale simulation methods for large biomolecular systems 伊東 真吾 計算科学研究センター 粒子系生物物理研究チーム Free energy calculation for reaction mechanism of biomolecules by QM/MM-MD simulations 信夫 愛 計算科学研究センター 粒子系生物物理研究チーム Prediction of protein-ligand binding affinities using the free-energy perturbation and generalized-ensemble methods 大西 順也 計算科学研究センター 複雑現象統一的解法研究チーム Numerical simulation of wetting processes on patterned surfaces 宮下 治 計算科学研究センター 計算構造生物学研究チーム Molecular dynamics simulations and structure modeling of biological macromolecules Ma Biao 計算科学研究センター HPC／AI駆動型医薬プラットフォーム部門 バイオメディカル計算知能ユニット Development of HPC/AI-Driven Platform Technologies for Next-Generation Pharmaceutical Development 千葉 峻太朗 計算科学研究センター HPC／AI駆動型医薬プラットフォーム部門 分子デザイン計算知能ユニット Molecular optimization of biofunctional polymer properties 山根 努 計算科学研究センター HPC／AI駆動型医薬プラットフォーム部門 分子デザイン計算知能ユニット 分子動力学シミュレーション解析人工知能システムの応用研究 金田 亮 計算科学研究センター HPC／AI駆動型医薬プラットフォーム部門 AI創薬連携基盤ユニット 心臓シミュレーターUT-Heartと粗視化分子シミュレーターCafeMolの架橋 Bun Chan 計算科学研究センター AI for Scienceプラットフォーム部門 材料・物性アプリインターフェース基盤開発ユニット Rigorous DFT across the periodic table William Dawson 計算科学研究センター AI for Scienceプラットフォーム部門 材料・物性アプリインターフェース基盤開発ユニット Large Scale Quantum Mechnical Calcuations: Computation and Analysis 仲澤 一輝 量子コンピュータ研究センター 半導体量子情報デバイス理論研究チーム カイラル物質における非線形輸送特性とバンドトポロジーの数値解析 関 和弘 量子コンピュータ研究センター 量子計算科学研究チーム Numerical simulation of quantum many-body systems 後藤 隼人 量子コンピュータ研究センター 量子コンピュータアーキテクチャ研究チーム 量子誤り訂正および誤り耐性量子計算のシミュレーション Li Chao 革新知能統合研究センター 汎用基盤技術研究グループ テンソル学習チーム Reliable Machine Learning Approach for Medical Imaging Processing 櫻井 利恵子 革新知能統合研究センター 目的指向基盤技術研究グループ 遺伝統計学チーム Gene similarity deriving from the ancestral recombination graph (ARG) for predicting disease occurrences Adnan Sljoka 革新知能統合研究センター 目的指向基盤技術研究グループ 分子情報科学チーム Protein structure and function studies with AI and simulations 濱崎 甲資 革新知能統合研究センター 目的指向基盤技術研究グループ 分子情報科学チーム 育種分野におけるベイズ最適化強化のための大規模言語モデルの活用 隅田 真人 革新知能統合研究センター 目的指向基盤技術研究グループ 分子情報科学チーム 人工知能による化学データのデジテル化と大規模分子設計 渡邉 千鶴 生命医科学研究センター 制御分子設計研究チーム Application of biomolecular simulation with high accuracy to in silico screening 新津 藍 生命医科学研究センター 生体分子動態デザイン研究チーム Computational design and molecular dynamics simulations of biomolecules 石垣 和慶 生命医科学研究センター ヒト免疫遺伝研究チーム Elucidation of human autoimmunity pathology 美川 務 生命医科学研究センター 翻訳構造解析研究チーム 乳酸酸化酵素のループ領域の分子動力学的解析 芦崎 晃一 生命医科学研究センター 予測医学特別プロジェクト 開放系情報科学特別チーム Study for visualization of skin conditions based on health and medical data 山崎 俊夫 生命医科学研究センター 次世代マグネット開発連携ユニット simulation of NMR and magnet 沖本 憲明 生命機能科学研究センター 計算分子設計研究チーム Molecular dynamics study on formation of protein-ligand complex 平野 秀典 生命機能科学研究センター 計算分子設計研究チーム 共有結合化合物のタンパク質構造への影響についての計算科学的研究 浦長瀬 正幸 生命機能科学研究センター 計算分子設計研究チーム Analysis on mechanisms of allosteric inhibition of P38α using cosolvent method 本多 久夫 生命機能科学研究センター フィジカルバイオロジー研究チーム 多細胞生物の形態形成 Qi Lin 脳神経科学研究センター 人間認知・学習研究チーム The neural mechanism of vison and memory in the human brain 座間 拓郎 脳神経科学研究センター 人間認知・学習研究チーム 中断後の制御状態再構成を支える神経動態システムの解析 Xu Fangke 脳神経科学研究センター 神経細胞多様性研究チーム Gene Expression and Chromatin Status in C4da neurons after activation Greimel Peter 脳神経科学研究センター 細胞機能探索技術研究チーム Ligand-Protein, Protein-Lipid and Lipid-Lipid Interactions 野村 高志 脳神経科学研究センター タンパク質構造疾患研究チーム アミロイド構造に基づく機能性バインダーの計算科学的設計 宮武 秀行 脳神経科学研究センター 分子精神病理研究チーム 脳関連疾患の薬剤開発 Emi Ling 脳神経科学研究センター 脳レジリエンス研究チーム Multi-omic insights into brain-aging pathways Magdaline Akinyi Otieno バイオリソース研究センター 統合情報開発室 Machine Learning-Based identification of epigenetic regulation of basal Transposable Elements During Viral Infection. Gen Luo 環境資源科学研究センター 先進機能触媒研究グループ Theoretical simulation on transition-metal mediated chemical transformations 河村 伸太郎 環境資源科学研究センター 触媒・融合研究グループ 触媒反応の機構研究 五月女 宜裕 環境資源科学研究センター 触媒・融合研究グループ 計算化学を基盤とする新触媒・新反応・新機能開拓 Max Minne 環境資源科学研究センター 細胞機能研究チーム single-cell and spatial transcriptomics on plant regeneration 浅子 壮美 環境資源科学研究センター 機能有機合成化学研究チーム Ligand Design for Substrate Recognition and Reaction Control 丹羽 節 環境資源科学研究センター 機能有機合成化学研究チーム 金属錯体と光照射を駆使した共有結合形成制御 江副 晃洋 環境資源科学研究センター バイオ生産情報研究チーム Prediction for functional divergence in wheat homoeologous gene pairs 山口 滋 環境資源科学研究センター バイオ高分子研究チーム 分子構造の回帰分析に基づく触媒の最適形状探索 野村 幸汰 環境資源科学研究センター バイオ高分子研究チーム Synthesis of polypeptides for use as functional and structural materials 藤田 雅弘 環境資源科学研究センター バイオプラスチック研究チーム バイオベースポリマーの構造形成に関する研究 小川 友希 環境資源科学研究センター 細胞生産研究チーム MD simulation of enzyme 山﨑 明広 環境資源科学研究センター 理研－ケンブリッジ大学作物共生学連携研究チーム Comprehensive understanding of arbuscular mycorrhizal symbiosis 野川 俊彦 環境資源科学研究センター 技術基盤部門 分子構造解析ユニット 天然化合物の絶対立体配置決定への計算科学的アプローチ 新城 一矢 創発物性科学研究センター 計算量子物性研究チーム サブサイクルパルスで励起した強相関電子系 Yixuan Huang 創発物性科学研究センター 計算量子物性研究チーム Spin supersolid in the spin-1/2 triangle lattice Heisenberg antiferromagnets 新城 一矢 創発物性科学研究センター 計算量子物性研究チーム 量子ユニタリ回路ダイナミクスの古典計算機シミュレーション Yanming Ma 創発物性科学研究センター 計算物質科学研究チーム Ab-initio structure search orientated design of room-temperature superconductors in ternary hydrid 浅井 僚眞 創発物性科学研究センター 計算物質科学研究チーム ニッケル酸化物超伝導体の第一原理計算 畑中 樹人 創発物性科学研究センター 計算物質科学研究チーム Development of First-Principles Methods for Evaluating Higher-Order Spin Interactions and Their Application to Material Design Ming-Chun Jiang 創発物性科学研究センター 計算物質科学研究チーム Electron-phonon mediated superconductivity Kirill Bulgarevich 創発物性科学研究センター 創発分子機能研究グループ 新規有機半導体材料の開発 伹馬 敬介 創発物性科学研究センター 創発機能高分子研究チーム Electronic state calculations on organic semiconducting polymers 夫 勇進 創発物性科学研究センター 創発超分子材料研究チーム Excited State Control of Organic Molecules 西川 浩矢 創発物性科学研究センター ソフトマター物性研究チーム 極性流体キラル工学の展開のための分子設計 Fan Zhang 創発物性科学研究センター 量子機能システム研究グループ Automatic Tuning of Quantum Spin Qubit by Reinforcement Learning 中西 健 創発物性科学研究センター 量子凝縮体研究チーム 物理学にインスパイアされた機械学習の基礎研究 Suraj Kabir Salihu 創発物性科学研究センター スピン物性理論研究チーム Optimizing the catalytic efficiency of transition metal alloys for H2 energy production 山下 大喜 光量子工学研究センター 量子オプトエレクトロニクス研究チーム 低次元材料とフォトニクスの融合による光集積デバイスの開発 Natthajuks Pholsen 光量子工学研究センター 量子オプトエレクトロニクス研究チーム Design of photonic crystal nanocavity 田中 拓男 光量子工学研究センター メタフォトニクス研究チーム メタマテリアルの電磁気学特性解析 杉山 和靖 光量子工学研究センター 画像情報処理研究チーム 移動境界流れの数値シミュレーションに関する研究開発 Sun Zhe 光量子工学研究センター 画像情報処理研究チーム Development of human visual system-inspired image processing system 野田 茂穂 光量子工学研究センター 画像情報処理研究チーム Development of blood flow simulator using medical images 大谷 知行 光量子工学研究センター テラヘルツイメージング研究チーム Data analysis of cosmic microwave background polarization observation experiment GroundBIRD 若林 泰生 光量子工学研究センター 中性子ビーム技術開発チーム 理研小型中性子源RANSの開発のための独自関数および核データライブラリーを用いた中性子発生計算 大西 純一 仁科加速器科学研究センター 加速器基盤研究部 イオン源開発チーム RIBF 加速器の電磁場および構造計算 馬場 秀忠 仁科加速器科学研究センター RIビーム基盤開発部 情報処理技術チーム RIBFビーム実験生データのバックアップ／研究記録管理 大西 哲哉 仁科加速器科学研究センター 実験装置開発部 Radiation calculation in the RI production 磯部 忠昭 仁科加速器科学研究センター RI物理研究部 Experimental study of asymmetric nuclear matter equation of state by using heavy RI collision at RIBF Supparat Charoenphon 仁科加速器科学研究センター 核構造研究部 Point defect engineering in functional metal oxides. Phanthip Jaikaew 仁科加速器科学研究センター 核構造研究部 Muon beamline design at J-PARC by using the Monte-Carlo particle tracking simulation Wan Nurfadhilah Binti Zaharim 仁科加速器科学研究センター 核構造研究部 Computational Studies of Muon Locations, Electronic Structures and Electron Transport in Biological Systems Dita Puspita Sari 仁科加速器科学研究センター 核構造研究部 DFT Calculations on Organic Conductors as Supports for Muon Spin Spectroscopy 仁尾 真紀子 仁科加速器科学研究センター 少数多体系物理研究室 Precision QED calculations of the lepton anomalous magnetic moments 山下 琢磨 仁科加速器科学研究センター 少数多体系物理研究室 Few-body calculation of quantum reactive scattering including exotic atoms and molecules 高嶋 聡 仁科加速器科学研究センター 宇宙放射線研究室 Monte Carlo simulation for X-ray interactions with a warped accretion disk 望月 優子 仁科加速器科学研究センター 雪氷宇宙科学研究室 Galactic supernova explosion and its effect on the Earth 四日市 悟 仁科加速器科学研究センター RHIC物理研究室 高エネルギー原子核物理学 森田 竜平 仁科加速器科学研究センター イオン育種研究開発室 重イオンビーム照射により誘発された変異同定のための全ゲノムシーケンス解析 城地 保昌 放射光科学研究センター 先端放射光施設開発研究部門 制御情報・データ創出基盤グループ ビームライン制御解析チーム Simulation for XFEL nano-imaging 小松 輝久 最先端研究プラットフォーム連携(TRIP)事業本部 統合データ・計算科学プログラム 研究DX基盤開発チーム pilot study of rdx 小山 洋平 最先端研究プラットフォーム連携(TRIP)事業本部 統合データ・計算科学プログラム 研究DX基盤開発チーム 研究DXのための数値解析手法の開発と応用
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